Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccbe1Q3MI99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccbe1Q3MI99 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms