Protein–RNA interactions for Protein: Q2WG77

Ripply1, Protein ripply1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply1Q2WG77 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ripply1Q2WG77 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ripply1Q2WG77 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms