Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim71Q1PSW8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim71Q1PSW8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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