Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ptchd1Q14B62 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ptchd1Q14B62 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms