Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpusd2Q149F1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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