Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc39dQ0VF76 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc39dQ0VF76 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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