Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rundc1Q0VDN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rundc1Q0VDN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms