Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ubxn2bQ0KL01 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ubxn2bQ0KL01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms