Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NeblQ0II04 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NeblQ0II04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms