Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgm3Q08189 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms