Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
F13bQ07968 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
F13bQ07968 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F13bQ07968 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms