Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmbpQ07456 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmbpQ07456 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms