Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cdx4Q07424 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cdx4Q07424 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms