Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf3Q07104 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms