Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tie1Q06806 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tie1Q06806 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms