Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc2Q05020 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc2Q05020 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms