Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk18Q04899 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk18Q04899 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms