Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox9Q04887 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sox9Q04887 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox9Q04887 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms