Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smarcad1Q04692 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smarcad1Q04692 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms