Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddr1Q03146 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddr1Q03146 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms