Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa1Q00623 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms