Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab33aP97950 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33aP97950 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms