Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfdP97946 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfdP97946 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms