Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AlkP97793 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AlkP97793 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
AlkP97793 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AlkP97793 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AlkP97793 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AlkP97793 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AlkP97793 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AlkP97793 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AlkP97793 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AlkP97793 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AlkP97793 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AlkP97793 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms