Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cmklr1P97468 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cmklr1P97468 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms