Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H3f3aP84244 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H3f3aP84244 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms