Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Irx1P81068 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx1P81068 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms