Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx3P81067 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx3P81067 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms