Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr1bP70700 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms