Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ufd1P70362 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufd1P70362 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms