Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp7P70280 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp7P70280 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms