Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stra8P70278 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Stra8P70278 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms