Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxd13P70217 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxd13P70217 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms