Protein–RNA interactions for Protein: P69744

Trpv5, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 5, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv5P69744 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv5P69744 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv5P69744 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trpv5P69744 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trpv5P69744 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trpv5P69744 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms