Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rps28P62858 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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