Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan5P62080 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms