Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf13P61216 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms