Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf3P61205 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf3P61205 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf3P61205 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms