Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem258P61166 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms