Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppfia3P60469 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppfia3P60469 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms