Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp25P57080 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp25P57080 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp25P57080 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp25P57080 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp25P57080 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp25P57080 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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