Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdcd5P56812 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms