Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TdgP56581 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TdgP56581 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TdgP56581 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TdgP56581 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TdgP56581 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TdgP56581 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TdgP56581 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms