Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctbp2P56546 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms