Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd38P56528 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms