Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp5P56399 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp5P56399 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp5P56399 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms