Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GferP56213 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GferP56213 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GferP56213 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GferP56213 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GferP56213 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GferP56213 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GferP56213 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GferP56213 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GferP56213 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GferP56213 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GferP56213 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms