Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtskP55097 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtskP55097 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtskP55097 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms