Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ephb3P54754 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ephb3P54754 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms