Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A3P53794 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A3P53794 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A3P53794 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A3P53794 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A3P53794 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A3P53794 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms